Autonomous research infrastructure

把复杂科研,变成一次点击。

从分子对接、虚拟筛选与分子动力学,到网络药理学、机器学习和跨组学分析。LKStudio 把冗长流程收束为可验证的自动化工作流,让研究更快抵达发现。

7款软件
100+个功能模块
3 端Mac/Windows/Linux 系统无缝运行
分子对接虚拟筛选蛋白对接分子动力学网络药理学机器学习单细胞空间转录组孟德尔随机化SCI 图文报告 分子对接虚拟筛选蛋白对接分子动力学网络药理学机器学习单细胞空间转录组孟德尔随机化SCI 图文报告

为科研而生,为您重新设计。

LKDock 全流程分子对接与 LKFlow 生信分析平台,两大旗舰产品覆盖从分子到组学的完整科研工作流。

三种方式,即刻拥有。

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从一次使用,进入持续连接的科研平台。

把 101 个软件功能模块、教程答疑、问题反馈、客服支持、成果展示和在线分析连接起来,让用户从安装、上手到复现都有清晰入口。

PHASE 01 · LKSTUDIO

LKStudio 在线分析平台

网页上传数据、选择工作流、排队计算并下载报告。优先支持 LKFlow 高频模块与 LKDock 批量对接,降低本地环境依赖。

  • 任务队列可监控进度
  • 结果中心图、表、报告统一归档
  • 计算资源CPU / GPU 弹性运行
内测登记已开放 · 任务系统规划中
预约内测 →
COMMUNITY

用户社区 / 论坛

沉淀教程问答、参数配置、报错复盘和项目案例。建议先采用 GitHub Discussions 或论坛系统托管,成熟后再迁入自有平台。

现已上线 进入社区与反馈 →
FEEDBACK

反馈与需求投票

集中收集功能请求、Bug、教程缺口和版本建议,公开状态与优先级,避免需求散落在多个聊天群。

反馈表单已上线 提交反馈与需求 →
SUPPORT

直连客服 / 售前咨询

保留微信群主与助理入口,同时可接入企业微信、Crisp 或 Intercom 式客服组件,记录常见问题并形成服务闭环。

客服入口已上线 进入客服支持 →
KNOWLEDGE BASE

开发者文档与成果库

把开源引擎、参数说明、复现步骤、真实结果和版本更新集中到统一导航中,方便用户检索、引用与复现。

现有资源可直接使用

真实使用,论文里也应该被看见。

使用 LKDock 或 LKFlow 完成分析并发表论文,在方法、正文、致谢或参考文献中提及软件、LKStudio 或官网 https://lkstudio.org,可按论文分区申请成果回馈。

查看规则并申报 →
100%方法 / 正文 / 致谢 / 参考文献
50%使用但论文未提及
按篇每篇论文独立审核

真实操作演示,快速了解自动化能力。

精选 LKFlow 与 LKDock 全流程演示内容,覆盖复方网络药理学、网络毒理学、Cytoscape 网络图自动生成、全自动分子对接、分子动力学模拟等

Network Pharmacology
网络药理学全自动
一键完成复方网络药理学分析,覆盖成分、靶点、疾病、富集与结果整理等关键流程。
Cytoscape Auto Plot
Cytoscape 绘图全自动
自动生成网络药理学网络图,帮助用户从分析结果快速进入可视化展示与论文图表整理。
Compound Network Pharmacology
复方网络药理学全流程操作
10 分钟完成药物与疾病靶点获取、VENN 交集分析,以及“药物-成分-靶点-疾病”网络图构建。
Network Toxicology
网络毒理学全流程操作
完整演示 GEO、ADMETlab、CTD、Swiss、GeneCards、OMIM、PPI / GO / KEGG、机器学习与诊断模型分析流程。
Molecular Docking
全自动分子对接演示
8 分钟完成 25 对分子对接,展示 LKDock 在批量对接、效率提升与结果整理方面的自动化能力。
Molecular Dynamics
全自动分子动力学模拟演示
完整展示 LKDock v4.0 的 Windows 全自动分子动力学(MD)一键式配置、GROMACS 模拟运行与自动化分析。

承接开源积累,让科研工具更好用。

在优秀开源项目的基础上,结合真实科研使用场景进行持续打磨,补齐跨平台发行、金属酶 / 共价对接、Rust 高性能实现等关键能力。

从安装到上手,全程有教程。

关注公众号 / 小红书 / B站 / 抖音:罗柯生信,查看完整视频与图文教程。

PART 1软件模块教程
LKDock
全流程分子对接平台 · v1.0 / v2.0 / v3.0 / v4.0
6 TUTORIALS
LKDock 安装教程
LKDock v1.0 使用教程
LKDock v2.0 使用教程
LKDock v3.0 使用教程
LKDock v4.0 使用教程
LKDock001 使用教程
LKFlow
零编程生信分析平台 · 11 大板块 101 功能模块
3 TUTORIALS
LKFlow 安装教程
LKFlow 使用教程
LKFlow 全流程演示
更多专题教程分子模拟 · 网络药理学 · 转录组 · 单细胞 · 空间转录组 · 孟德尔随机化 LKFlow 2.0 专题教程规划 · 第 8–10 章(单细胞 / 空间转录组 / 孟德尔随机化)57 支 · 陆续上线 查看完整清单 →
PART 2功能专项教程
分子模拟教程
分子对接 · 虚拟筛选 · 蛋白质对蛋白质 · 分子动力学模拟
4 TUTORIALS
分子对接专项教程
蛋白质对蛋白质专项教程
分子动力学模拟专项教程
网络药理学教程
复方网络药理学 · 单体网络药理学 · 网络毒理学 · 逆向网络药理学
2 TUTORIALS
复方网络药理学实操演示
网络毒理学全流程演示
转录组教程
差异表达分析 · WGCNA · 富集分析 · 免疫浸润
3 专题 · 规划中
转录组分析专项教程
WGCNA 专项教程
免疫浸润专项教程
单细胞教程
单细胞转录组 · 细胞类型注释 · 轨迹分析 · 细胞通讯
42 集 · 规划中
单细胞入门专项教程
细胞通讯专项教程
轨迹分析专项教程
空间转录组教程
空间转录组分析 · 空间变异基因 · 细胞类型去卷积 · 空间通讯
8 集 · 规划中
空间转录组入门专项教程
空间去卷积专项教程
空间通讯专项教程
孟德尔随机化教程
两样本 MR · 多变量 MR · 中介分析 · 共定位分析
7 集 · 规划中
两样本孟德尔随机化专项教程
多变量孟德尔随机化专项教程
中介与共定位分析专项教程

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LKDock 试用
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参考文案
LKDock ——全流程分子对接平台,v1.0 / v2.0 / v3.0 / v4.0 四个版本满足不同阶段需求。 v1.0:一键查询、一键下载配体受体、一键预处理、一键生成对接盒子,支持最高同时 30 对对接、一键分析结果、一键导出 3D 图、一键生成 PDF 论文报告。 v2.0:新增 GPU 对接引擎、虚拟筛选、多肽对蛋白、小分子对小分子、多肽对核酸、ADME 预测、高级可视化、中药成分查询、蛋白种属查询、柔性对接、多配体对接。 v3.0:新增蛋白-蛋白对接、RNA/DNA 核酸对接、膜对接、口袋自动预测、113 种金属离子对接、PyMOL 2D/3D 可视化,支持 100+ 任务同时运行,Win / macOS / Linux 全平台可用。 v4.0:全新升级全自动分子动力学模拟、13 种覆盖全场景的计算体系(深度支持蛋白、配体、核酸、多肽及小分子等互作),并集成高达 34 种学术分析功能模块。
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LKFlow 试用
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LKFlow 2.0 —— 零编程、全自动、一键式、下载即用!11 大板块、101 个模块,从 GEO 数据挖掘到网络药理学、机器学习、单细胞、空间转录组与孟德尔随机化,跨组学一键闭环。 经典分析:GEO 下载、DEGs 差异表达(limma / DESeq2 / edgeR)、WGCNA 共表达网络、复方/单体网络药理学、GO/KEGG 富集、10/127/207 种机器学习建模、SHAP 可解释性分析、免疫浸润(CIBERSORT / ssGSEA)、GSEA/GSVA、列线图、KM 生存分析、药敏分析。 2.0 新增:单细胞转录组全套(QC 质控、细胞注释、轨迹分析、CellChat / NicheNet 细胞通讯、hdWGCNA、虚拟扰动等)、空间转录组 7 大分析流水线、孟德尔随机化全流程(标准 / 多变量 / 双向 / 共定位 / 药物靶点)。 自动生成学术图文报告,单细胞 / 空间 / MR 全套图表可直接用于论文,一键完成一篇高水平 SCI 论文!
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持续迭代,一步步完善产品矩阵。

从 LKDock v1.0 演进至 v4.0,从 LKFlow 16 个模块扩展到 101 个功能模块,罗柯生信产品线持续围绕自动化科研工作流迭代升级。

2025.9.24
LKDock v1.0 上线
全自动分子对接平台首次上线,2 分 28 秒完成 5 对分子对接,一键运行下载、预处理、自动适配对接盒子、多线程分子对接、结果分析与论文生成。
2025.11.26
LKDock v2.0 上线
LKDock 进入增强版本阶段,进一步扩展对接引擎、可视化、GPU 加速与高级对接能力。
2025.12.9
LKFlow 上线 · 16 个模块
LKFlow 正式上线,初始版本包含 16 个模块,开启一键式网络药理学与生信分析平台迭代。
2025.12.12
LKDock001 上线
LKDock001 内容上线,继续补充 LKDock 相关功能展示与教程材料。
2026.1.6
LKFlow 更新至 25 个模块
LKFlow 分析能力扩展至 25 个模块,覆盖更多生信分析与网络药理学场景。
2026.4.16
LKFlow 更新至 40 个模块
LKFlow 扩展至 8 大功能板块、40 个分析模块,形成完整的一键式生信与网络药理学工作流。
2026.5.1
LKlight 开源项目发布
基于 Rust 开发的高性能蛋白-蛋白对接工具正式开源,面向工业级和学术界大分子计算场景,提供更快的运算速度和更好的数值稳定性。
2026.5.2
LK-UniDock 开源项目发布
全新 GPU 跨平台分子对接算力引擎开源上线,彻底攻克和补齐了原有引擎在 Windows 与 Linux 环境下的本地 GPU 硬件加速限制。
2026.5.3
LKina 开源项目发布
基于 Vina 算法重构升级的高性能对接工具开源发布,重点攻克了金属酶配位特异性定向、以及 P1-P4 智能响应式共价分子对接等前沿需求。
2026.5.3
LKDock v3.0 上线
LKDock v3.0 专业版上线,进一步补齐大分子对接、口袋预测、共价对接、2D 可视化与完整专业版能力。
2026.6.1
LKDock v4.0 旗舰版上线
LKDock 4.0 旗舰版本重磅发布!全自动分子动力学模拟、13 种覆盖全场景的计算体系(深度支持蛋白、配体、核酸、多肽及小分子等互作),并集成高达 34 种学术分析功能模块。
2026.9.1
LKFlow 2.0 上线 · 11 大板块与 101 个功能模块
LKFlow 2.0 正式发布:在 40 个经典模块基础上,新增单细胞转录组、空间转录组、孟德尔随机化与非靶向代谢组/脂质组,扩展至 11 大板块、99 个分析模块;加上生成报告和思路启发,共 101 个功能模块,完成 bulk → 单细胞 → 空间 → 因果 → 代谢的跨组学闭环。
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